在对阳痿患者进行体格检查时，除了对内分泌系统疾病、神经系统疾病和心血管系统疾病的常见体征进行有针对性的重点检查外，生殖系统的检查更是必不可少的。
阴茎
阴茎的大小、外形是首先应该观察的。有人统计，正常人阴茎长度约为7.25~11.5cm，周径约7.5~10.5cm，勃起时长度可达到12~21cm，周径可达到8.5~12cm。肥胖的患者阴茎往往较小，应注意区别肥胖是生理性的还是病理性的，若为病理性肥胖则应该进一步寻找肥胖的原因，对于生理性肥胖患者，有时由于会阴部脂肪层过厚导致阴茎埋藏于会阴部皮下脂肪层内而被误认为阴茎短小。
阴茎的外形主要指有无包皮过长、包茎、包皮粘连，有无发育畸形，尿道下裂或上裂、外生殖器模棱两可等情况。同时还应该沿着阴茎长轴进行仔细触诊，以发现早期的纤维性阴茎硬结。
睾丸
男性性腺睾丸的大小、质地及位置也需要重点检查，因为这是是否存在雄性激素分泌不足最为直接的证据。
双侧睾丸体积均小者多为下丘脑-垂体-睾丸轴存在病变，若只有一侧睾丸体积偏小则常为局部因素如外伤扭转、精索静脉曲张、睾丸炎等引起。当然，只有一侧体积偏小是一个需要谨慎把握的指标，因为正常男性的两侧睾丸也不可能完全等大。
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