女性患有甲亢后，在病情没有得到很好的控制前，一般不建议怀孕，因为妊娠合并甲亢可以导致先天性胎儿发育异常，还可能发生早产及娩出低体重儿，并发妊高症的风险也会大大高于没有患有甲亢的妇女，因此应在甲亢治愈后才考虑妊娠。
许多女性在妊娠期感觉疲劳、多汗、多食消瘦、烦躁易怒，结果经过检查诊断为甲状腺功能亢进。这时候，只要及时得当的进行治疗，妊娠合并甲亢的妇女一样可以生出健康的宝宝。由于妇女在妊娠期服用的药物会部分通过胎盘而进入胎儿体内，因此在选择药物时应慎重。
妊娠期甲亢患者应选用相对较少通过胎盘的药物，妊娠早期即可开始应用抗甲状腺药物，此时胎儿甲状腺尚未发育成熟，不具有正常功能，因此抗甲状腺药物对胎儿的甲状腺影响较小。
孕早期快速控制甲亢症状，以利于妊娠中晚期可以将药物减量。在选择药物时，甲基硫氧嘧啶由于分子量较大，较少通过胎盘，为妊娠期糖尿病的首选药物。在妊娠中期，胎儿的甲状腺功能基本成熟，这时候患者抗甲状腺药物就需减量至最小有效量。妊娠中晚期患者的甲状腺功能不易控制较严格，只需保持较正常人稍高的水平即可。
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