脂肪肝按人体自身素质、饮食习惯不同和导致脂肪肝的发病原理不同，一般可分为肥胖性脂肪肝，肝炎后脂肪肝，酒精性脂肪肝，营养缺乏性脂肪肝，药物性脂肪肝，糖尿病性脂肪肝，妊娠性脂肪肝和不明原因的隐源性脂肪肝等。
不同种类的脂肪肝治疗难度也不同。
病因不明
像肥胖性脂肪肝，酒精性脂肪肝，营养缺乏性脂肪肝，药物性脂肪肝，糖尿病性脂肪肝这些病因明确的脂肪肝，只要积极清除病因，脂肪肝就有治愈的可能。而病因不明的脂肪肝，由于缺少最根本的有针对性的治疗措施，大多治疗困难。
治疗依从性差
脂肪肝的治疗需要医生和患者的双方配合。但是许多酒精性脂肪肝患者不能按照医生的指示坚持戒酒，肥胖性脂肪肝患者不能按计划节食和运动，这些都会使脂肪肝难以治愈。
合并重症肝炎
一旦患者患有重症肝炎，肝功能就会急剧下降，所能耐受的药物就会减少，增加了治疗的限制，而且重症肝炎本身是威胁生命的疾病，只有处理好重症肝炎后才可以考虑脂肪肝治疗。
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