当多系统衰竭以帕金森综合征为主要表现时，便易与帕金森病相混淆，故应对两者进行仔细区分。
1.疾病性质不同
帕金森为中枢神经系统变性疾病。
多系统衰竭为一组神经系统多部位进行性萎缩的变性疾病或综合征。
2.发病年龄不同
帕金森多发生于50~60岁以上的中老年人，但也可发生于儿童期或青春期。
多系统萎缩为成年期起病，呈进行性发展并于50~60岁多见。
3.症状不同
帕金森常以静止性震颤为首发症状，多始发于一侧上肢远端，典型表现是频率为4~6Hz的“搓丸样”震颤；行动迟缓以动作变慢、始动困难为主要表现，如步距缩小、手臂摆动幅度变小等；走路易跌倒、行走时越走越快而不易止步、疲劳感、睡眠障碍、情绪低落、认知障碍等，也为本病症状。
多系统衰竭往往以自主神经功能障碍为首发症状，可表现为尿失禁、男性勃起障碍（男性首发症状）、体位性低血压、瞳孔大小不等、呼吸困难、手脚发凉等；小脑性共济失调为突出症状，以眼球震颤、进行性步态、构音障碍为主；帕金森综合征主要表现为行动迟缓，并伴有肌强直及震颤，肢体双侧可同时受累。
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