艾滋病毒是通过激活炎症细胞后，产生一些叫做“炎症因子”的化学物质，可使肺动脉中层平滑肌细胞增厚、内层内皮细胞损伤。因此，只要感染艾滋病病毒，即使并没有发展成艾滋病，也容易发生肺动脉高压。
艾滋病感染者发生肺动脉高压的发病率大约为1/200，其确切的发病机制尚不清楚。体内和体外实验显示艾滋病并不感染肺血管内皮细胞，在艾滋病合并肺动脉高压患者肺血管组织内也没有检测到艾滋病的DNA等。
研究发现艾滋病度包膜蛋白gp120可导致肺血管内皮细胞分离和崩解，可以诱导细胞凋亡，DNA裂解程度和浓度没有明显相关。gp120蛋白可以促进肺血管内皮细胞分泌内皮素-1，内皮素的分泌与gp120蛋白作用的时间和浓度成正相关。艾滋病合并肺动脉高压的发生可能与基因易感染性有关，白细胞抗原系统HLA-DR6和HLA-DR52表型的患者，肺动脉高压的发病率明显增高。
艾滋病合并肺动脉高压最常见的症状表现为进行性呼吸困难，同时可伴有踝部水肿，干咳，胸痛、疲乏甚至昏厥，其临床表现缺乏特异性。
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