生殖器疱疹是常见的性传染病之一，关于生殖器疱疹的实验室检查方法有如下几种。
（1）培养法在水疱基底部取材做组织培养分离病毒，为目前较敏感、最特异的检查方法，是生殖器疱疹的实验室检查的“金标准”，需2-4天，最长可达14天，目前有改良方法可缩短时间，对技术条件要求高，价格较贵。
（2）细胞学方法在水疱基底部取材后，对皮损刮片做巴氏染色或瑞氏一姬姆萨染色，可见HSV感染细胞出现胞浆空泡，有时可见HSV感染特征的巨细胞包涵体，但不能区别HSV感染或水痘，敏感性仅为抗原检测法、DNA检测法或病毒分离培养法的60%。
（3）抗原检测包括直接免疫荧光试验、免疫酶染色和酶联免疫吸附试验（EUSA），用单克隆抗体等特异性抗病毒抗体进行检测。质量高、特异性好的试剂的敏感性可达病毒分离培养法的80%。
（4）抗体检测目前最广泛的是HSV-2抗体蛋白印迹法检测，采用病毒的型特异性的糖蛋白G（gG-1和gG-2）为抗原，可检测并区分血清中的抗1型病毒和抗2型病毒抗体，且敏感度特异性高。但对实验室条件要求较高。
（5）病理组织学诊断可见细胞内水肿，基底层形成大水疱，病灶周围有多核巨细胞浸润，病灶中间充斥着多核白细胞与淋巴细胞。
（6）电子显微镜检查在水疱或其他皮损中可见病毒颗粒，但敏感性低，也不能与其他疱疹病毒相区别。
（7）DNA或基因检测法如核酸杂交技术检测HSV病毒DNA，其敏感性和特异性与免疫荧光法相当，但操作复杂，对实验室要求高。
（8）聚合酶链反应（PCR）通过PCR将病毒DNA片断体外扩增，可增加检出的敏感性，与病毒分离培养法及脑脊液病毒抗体检测相比，敏感性更高，且可对病毒进行分型。
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