以下实验室检查方法可用于检查诊断生殖器疱疹：
(1)病毒培养
从患者病变区的水疱底部取标本做组织病毒培养，阳性率可达60%～90%。
病毒培养是目前最敏感、最特异的检查方法。接种方法：取材时用醋酮(不能用酒精)消毒水疱，然后用干燥细针吸取疱液置于消毒试管内，立即进行培养和接种。培养48~72小时可见到特征性的细胞致病作用，此方法敏感性高，特异性强。若将疱液接种于家兔的角膜，能引起树枝状角膜炎反应。
(2)细胞学检查
将患者的标本经过特殊染色方法处理后，在涂片中寻找多核巨细胞和包涵体，其敏感性仅为病毒培养的60%。细胞学检查不能区分单纯疱疹病毒感染与水痘-带状疱疹病毒感染。
(3)病毒抗原检测
此方法对早期损害有较高的敏感性与特异性，常用的方法有酶免疫试验(EIA)、放射免疫测定(RIA)、免疫荧光方法及聚合酶链反应。
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