三叉神经痛手术治疗后复发的原因如下：
(1)可能是需要切断的三叉神经感觉纤维未被完全切断，或感觉后根内有节细胞异位生长，如做三叉神经感觉根减压术，而未切断感觉根者，远期复发率较高。
也有的病例手术后就无效，特别是行三叉神经周围支手术有其他病变末被发现者，如小脑桥脑角处有较小的肿瘤，异常细小的血管压迫后根入根区未被发现，蛛网膜粘连等，减压手术后疼痛又复发。因此，目前很少有人采用只作根囊切开减压而不切断感觉根的术式，尤其是顽固性三叉神经痛，更少有人采用此种术式。对小脑桥脑角因肿瘤压迫继发性三叉神经痛，作者认为除切除肿瘤减压外，还应在三叉神经感觉根出桥脑0.5～1厘米的后外切断2/3~1/2，以防术后复发。
(2)三叉神经周围支酒精阻滞和周围支切断撕脱术后，各学者均报道复发率较高。其复发原因多因前者为酒精凝固破坏不全。早在1936年Crant报道用酒精注射三叉神经周围支治疗三叉神经痛229例，结果全部复发，此类患者复发后检查三叉神经分布区域的感觉并没有恢复。这一事实说明，向三叉神经支内注射酒精，或将神经支切断撕脱，显然是达不到对本病恒久治愈的目的。
远期疼痛的复发则与神经纤维的再生或病因的继续存在或发展的原因有关。
(3)颞部入路(Frazier)手术，术后复发率有人报告为39%，复发的原因是此入路手术探查不到小脑桥脑角区存在刺激三叉神经感觉根的病变。
(4)经皮穿刺半月神经节射频热凝术，或注射甘油治疗三叉神经痛，复发率分别为23.3%和4.6%(近期随访)。复发的原因亦可能是未彻底处理病灶的关系。
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