生殖器疱疹的诊断主要通过临床表现，实验室诊断并不是主要的。但当临床不能确诊或需与其他生殖器溃疡进行鉴别时，实验室检查有助于临床诊断。此外，实验室诊断被推荐用于确定足月孕妇和新生儿是否感染HSV，也用于流行病学调查。
病毒的分离培养加PCR是实验室检测HSV的“金标准”。改良的培养法可缩短检测病毒时间，临床上对有症状患者首先使用该方法。
生殖器疱疹的治疗方法首选药物治疗，内用药物治疗分为以下几种：
一、抗病毒药物
(1)初发(原发生殖器疱疹可选择)
①阿昔洛韦，0.2g，4～5次/日，口服，连用7～10日。
②伐昔洛韦，0.3g，2次/日，口服，连用7～10日。
(2)复发性生殖器疱疹可选择
①短疗程：阿昔洛韦，0.2g，4～5次/日，连用5～7日;或伐昔洛韦，0.3g，2次/日，连用5～7日。
②长疗程：阿昔洛韦，0.2g，4～5次/日，连续4个月以上;或伐昔洛韦，0.3g，1~2次/日，连用4个月以上。
二、干扰素适用于复发性生殖器疱疹，可选择干扰素-a或干扰素-ß，疗程达数月
三、左旋眯唑适用于复发性生殖器疱疹，用法为50mg，每日3次，连服3日停11日，共4个月以上
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