生殖器疱疹为易复发疾病，目前尚无彻底治愈方法，其治疗以全身抗病毒药物为主，治疗目的是减轻症状，缩短病程，减少HSV排放，控制其传染性。
根据不同症状的患者，在药物治疗方面又有着很大的不同。
1、原发性生殖器疱疹
阿昔洛韦200mg，每日5次，口服，连用7-10日；或伐昔洛韦1000mg，每日2次，口服，连用7-10日；或泛昔洛韦250mg，每日3次，口服，连用5-10日。
2、复发性生殖器疱疹
最好在出现前驱症状或皮损出现24小时内开始治疗。阿昔洛韦200mg，每日5次，连服5日；或伐昔洛韦500mg，每日2次，连服5日；或泛昔洛韦125mg，每日3次，连服5日。
3、频繁复发患者
为减少复发次数，可用抑制疗法。阿昔洛韦400mg，每日2次口服;或伐昔洛韦500mg，每日1次口服；或泛昔洛韦250mg，每日2次口服。
这些药物需长期服用，一般服用4个月至1年。
4、严重感染患者
指原发感染症状严重或皮损广泛者。阿昔洛韦每次5-10mg/kg体重，每8小时1次，静脉滴注，连用5-7日或直至临床症状消退。
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