有人认为输血后庚型肝炎的潜状期平均为61天。已发现感染后病毒在体内可存在相当一段时间，已报道庚肝病毒核糖核酸（HGVRNA）可持续9年。急性庚型肝炎的血清丙氨酸氨基转移酶（ALT）升高幅度不如乙型肝炎或丙型肝炎。一般临床症状较轻，出现显性黄疸者，亦不如丙型肝炎多见，部分患者仅是无黄疸型加低水平转氨酶升高，甚至毫无症状。
对症处理后ALT多数在1月内恢复正常。由急性庚型肝炎转变成慢性庚型肝炎者较丙型肝炎少见，但病毒携带者并不少见。
庚型肝炎病毒感染后临床上可能有8种转归。
（1）一过性的病毒血症：病毒很快被人体清除，称为隐性感染。
（2）出现急性肝炎表现：单纯庚型肝炎病毒感染的ALT增高程度及黄疸深度可能比急性丙型肝炎轻，但临床上常与丙型肝炎，甚至乙型肝炎合并感染，多数患者很快康复。
（3）病毒持续存在：部分患者始终处于低滴度状态，少部分血清里含有中到高滴度的HGV，但均无临床症状，为无症状病毒携带者。
（4）病情迁延：转氨酶随血中病毒滴度的波动而出现间隙性增高，少数反复发作成为慢性肝炎。
（5）可能引起暴发型肝炎：多以亚急性重型肝炎为多见。
（6）庚型肝炎慢性感染到发生肝硬变需较长时间：但一旦发生肝硬变，病情往往急转直下，发展迅速。
（7）庚型肝炎是肝癌的相关因素：但大多数情况下，肝癌的发生可能是乙肝或丙肝病毒与庚肝病毒的协同作用。
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