婴儿肛瘘没有最好的治疗方法，只有最适合的方法。婴儿出现肛瘘后可进行药物治疗、手术治疗等，同时还要注意生活护理，帮助病情恢复。
一、药物治疗
1.抗感染药：如果婴儿的肛周有明显的红肿、破溃，并且还伴有流脓的情况，则考虑是细菌感染所引起，此时可以遵医嘱使用抗生素类药物来进行消炎杀菌处理，如阿莫西林颗粒、头孢克肟颗粒等。
2.止痛药：若婴儿在排便时疼痛比较严重，影响正常进食和睡眠的情况下，还可以适当应用布洛芬混悬液或对乙酰氨基酚片等药物来缓解症状。
二、手术治疗
对于病情较严重的婴儿而言，仅通过药物可能无法达到治愈的效果，还需及时到医院就诊，在医生操作下采取挂线疗法或者切开引流术等方式进行治疗，从而促进疾病恢复。
三、其他治疗
在日常生活中家长还需要做好相关护理措施，比如用高锰酸钾溶液坐浴，能够起到消毒以及清洁的作用，有助于改善局部炎症反应。另外，饮食上也要以清淡为主，避免进食辛辣刺激性食物，以免加重不适症状。
建议存在肛瘘的婴儿家长及时带其前往小儿外科就医，完善体格检查、实验室检查、影像学检查等明确诊断，然后根据不同情况选择合适的处理方式。
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