肛瘘可通过保守治疗、药物治疗、手术治疗等方式治疗。肛瘘一般是由肛周脓肿破溃或切开引流后形成的慢性感染性管道，主要表现为肛周反复流脓、肿痛等症状。
适用于无明显症状的单纯低位肛瘘。可使用1:5000高锰酸钾温水坐浴帮助保持肛门清洁，每次坐浴5-10分钟，水温40度左右为宜。同时要注意饮食习惯，避免辛辣刺激食物，保持大便通畅。
急性发作期可在医生指导下使用左氧氟沙星片或甲硝唑片控制感染。肛周红肿疼痛时可局部涂抹复方角菜酸酯乳膏缓解症状。肛瘘伴有便秘时应使用乳果糖口服溶液改善排便。
适用于低位单纯性肛瘘，通过在瘘管内放置弹性皮筋，利用切口逐渐切割的作用使瘘管缓慢被切开并愈合。该方法创伤较小但治疗周期较长约3-4周。
传统手术方式适用于低位单纯性或复杂性肛瘘，将瘘管完全切开使其开放愈合。术后需每日消毒换药约2-3周，愈合时间4-6周，存在一定的肛门变形风险。
适用于高位复杂性肛瘘，如肛瘘切除一期缝合术、推移皮瓣术等。这些术式在清除病灶的同时能更好保护肛门括约肌功能，但技术要求较高，需在有经验的医疗中心进行。
肛瘘患者日常应注意保持肛周清洁干燥，排便后可用温水清洗肛门。避免久坐久站，每日可进行适量提肛运动。饮食上宜清淡营养，多吃富含膳食纤维的食物如燕麦、芹菜等促进排便。如肛门出现反复流脓渗液或疼痛加剧等症状应及时就医复查，术后患者需严格遵医嘱进行创面护理和复查。
