单独E抗原阳性是乙肝感染，通常为急性感染，后期可能康复，也可能转为慢性乙型肝炎。
未感染过乙肝，且未接种过乙肝疫苗的人群，在第一次感染乙肝病毒的时候，属于急性感染，这种情况下由于乙肝各标志物出现时间不等，就可能出现乙肝E抗原单独阳性的情况。
乙肝E抗原单独阳性提示目前为乙肝急性感染，根据机体免疫力与乙肝病毒斗争的结果，后期可能康复或转为慢性乙型肝炎；如果机体免疫力强，能够将乙肝病毒完全清除，后期乙肝E抗原消失，乙肝表面抗体、乙肝E抗体及乙肝核心抗体转为阳性，则说明自愈了。
如果机体免疫力较弱，无法将体内的乙肝病毒清除，乙肝病毒感染逐渐慢性话，后期乙肝表面抗原、乙肝E抗原、乙肝核心抗体都为阳性，这种情况属于乙肝大三阳；乙肝大三阳病毒复制活跃，传染性强，需及时前往医院就诊，进行治疗。
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