新生儿化脓性脑膜炎未经治疗存活时间通常不超过数周至数月，具体生存期受感染病原体毒力、免疫状态、并发症严重程度等因素影响。该疾病致死率高达50%以上，存活患儿多遗留神经系统后遗症。
不同细菌导致的预后差异显著。B族链球菌感染进展相对缓慢，可能存活2-3个月；大肠杆菌感染病情凶险，未治疗者多在1-2周内死亡；李斯特菌感染合并多器官衰竭时，生存期可能缩短至数日。
早产儿因血脑屏障发育不全和免疫缺陷，病情恶化速度更快。极低出生体重儿未治疗时生存期较足月儿缩短50%，部分病例在感染后72小时内即可发生感染性休克。
脑积水可使生存期延长至3-6个月，但伴随严重脑萎缩；脑室管膜炎会加速病情进展；合并脓毒血症时，多数患儿在1周内因多器官功能衰竭死亡。
母乳喂养儿可能通过母源抗体获得部分保护，生存期较配方奶喂养儿延长1-2周；重度营养不良患儿因代谢紊乱和免疫抑制，生存时间缩短30%-40%。
即使未接受正规治疗，部分患儿可能因偶然使用广谱抗生素如母亲产时预防性用药暂时抑制细菌繁殖，生存期出现个体差异，但最终仍会进展至不可逆脑损伤。
新生儿化脓性脑膜炎属于医疗急症，建议立即住院进行脑脊液检查及静脉抗生素治疗。康复期需定期评估听力、视力及运动功能，喂养时注意少量多次避免呛咳，保持环境温度恒定在24-26℃。接触患儿前后需严格手卫生，避免交叉感染。出院后每月需进行神经系统发育评估直至2周岁，发现异常及时进行康复训练。
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