肠镜选择无痛或有痛需根据患者耐受度、检查目的及健康状况决定，无痛肠镜适合恐惧疼痛或需精细检查者，有痛肠镜适合心肺功能较差或需快速恢复者。
无痛肠镜通过静脉麻醉使患者在睡眠中完成检查，避免操作过程中的不适感，尤其适合对疼痛敏感、存在肛门括约肌痉挛或需进行息肉切除等复杂操作的患者。麻醉状态下肠道蠕动减少，有助于医生更清晰地观察黏膜细节，提高早期病变检出率。但需提前评估心肺功能，术后需有人陪同且当天禁止驾驶。
有痛肠镜不使用麻醉，检查过程中患者可能感到腹胀、牵拉痛等不适，但费用较低且无需麻醉复苏时间，适合轻度筛查或麻醉风险较高者。清醒状态下患者可配合医生调整体位，但肠道痉挛可能影响观察效果。检查后即可正常活动，适合需快速返回工作的人群。
无论选择哪种方式，检查前均需严格遵循3天低渣饮食和清肠准备，术后注意观察有无腹痛、便血等异常。合并严重心脏病、呼吸衰竭等患者应提前告知医生评估风险，妊娠期女性通常不建议无痛肠镜。根据个体情况与医生充分沟通后选择最适方案。
