乙肝抗病毒治疗目前尚无特效药物，治疗须根据病情，采取综合治疗措施。因人而异，制定符合患者本人的个体化治疗方案。
了解所感染的病毒基因型
国内外资料总结显示，不同区域病毒基因型分布是不同的。
众多研究表明B基因型的慢性乙肝患者对干扰素的应答比C基因型的好，应答率39％比17％；而拉米夫定及阿德福韦与基因型无关。
干扰素疗效预测
干扰素疗效预测是鉴定慢性乙肝患者基因型的分子检测工具，可预测慢性乙型肝炎患者对干扰素抗慢性HBV或HCV病毒感染治疗的反应性。在治疗前进行该检测，可帮助医师为乙肝患者制定个性化抗病毒治疗用药方案。
了解自身的细胞免疫功能
了解乙肝患者自身的细胞免疫功能可以有的放矢的进行抗病毒治疗。乙肝病毒的清除，最终还是依靠自身的免疫功能，特别是特异性免疫功能。
可以通过检测细胞亚群计数来了解乙肝患者自身免疫功能。
强调联合治疗
乙肝的治疗除了强调抗病毒治疗外，还必须正确认识抗病毒治疗的局限性，要注意在抗病毒治疗的同时，配合使用消除肝脏炎症的药物，抗纤维化药物以及免疫调节药物等。
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