临床中，全身型重症肌无力患者与肉毒中毒患者症状特征非常相似，需重点鉴别。
全身型重症肌无力
1、常最先累及眼外肌，表现为上睑下垂，斜视和复视，重者眼球固定，但瞳孔括约肌不受累;
2、咀嚼肌受累可致咀嚼困难;
3、咽喉肌受累出现构音障碍、吞咽困难、鼻音、饮水呛咳及声音嘶哑等;
4、四肢肌肉受累以近端为重;
5、呼吸肌受累时可出现咳嗽无力、呼吸困难，称重症肌无力危象，是致死主要原因。
6、肌无力症状晨轻暮重，持续活动后加重，经休息后缓解。
7、一般腱反射不受影响，感觉正常;
8、新斯的明试验阳性;
9、低频重复频率刺激可使波幅衰竭50%以上，单纤维肌电图测定的“颤抖”增宽;
10、血清学特征：可检测到AChR抗体或抗-MuSK抗体。
肉毒中毒
1、肉毒杆菌毒素累及神经肌肉接头突触前膜所致，病前有进食污染食品病史;
2、精神紧张、眼外肌麻痹、上眼睑下垂、眼外肌运动无力、眼球调节功能减退或消失、瞳孔扩大和对光反射迟钝，有些患者瞳孔两侧不等大;
3、重症者腭、舌、咽、呼吸肌呈对称性弛缓性轻瘫，出现咀嚼困难、吞咽困难、语言困难、呼吸困难等脑神经损害;
4、四肢肌肉弛缓性轻瘫表现深腱反射可减弱和消失。
但不出现病理反射，肢体瘫痪则较少见，感觉正常，意识清楚;
5、新斯的明试验部分有阳性反应;
6、低频重复电刺激无明显递减，高频重复电刺激可使波幅增高或无反应，取决于中毒程度;
7、对食物进行肉毒杆菌分离肌毒素鉴定。
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