合理应用抗病毒药物可避免和减少耐药HBV株的出现，乙肝患者在进行治疗过程中应考虑影响因素、制定个体化治疗方案、治疗过程中注意潜在的交叉耐药、监测耐药HBV、联合抗病毒治疗预防耐多药HBV产生。
1、考虑影响因素——乙肝患者在开始抗病毒治疗前仔细地考虑宿主、环境和病毒等因素，以免这些因素对慢性HBV感染的自然史产生高度影响。
2、制定个体化治疗方案——抗病毒药物的个体化治疗方案应当结合药物的有效性、安全性、疾病的严重性、先前的治疗史，尤其要注意耐药的发生率、危险因素、耐药HBV的表现。
3、治疗过程中注意潜在的交叉耐药——乙肝患者开始抗病毒补救治疗或联合疗法时注意现有的口服抗病毒药物之间潜在的交叉耐药。
4、监测耐药HBV——监测耐药HBV有助于减少耐药HBV的发生率和后遗症，在出现病毒或生化突破之前检测到耐药HBV亚种，应及时采用合适的补救治疗。
5、联合抗病毒治疗预防耐多药HBV产生——对慢性乙型肝炎采用单药、序贯抗病毒治疗可能会导致耐多药HBV的增加，可考虑慢性HBV感染的联合抗病毒治疗方案。
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