脓疱型牛皮癣属较严重的牛皮癣，治疗药物有较多的不良反应，因此，在治疗过程中要进行监测。
常用的药物甲氨蝶呤，是一种拮抗叶酸的细胞毒性剂，长期应用可引起白细胞下降、口腔溃疡、食欲不振、恶心、腹痛、腹泻、脱发、牙龈出血、便血及肝脏广泛性纤维化和肝硬变等，故每半个月要常规进行血常规、肝肾功能的检查，必要时进行肝B超检查，总剂量达1克时，需要肝活检。低蛋白血症可增加甲氨蝶呤的血浆浓度，须特别注意。
酸类药物可使血脂升高，少数病例肝转氨酶增高，用药期间要随访肝功能及血脂，尤其是有心血管疾病基础的患者，更应警惕血脂异常可能导致的心、脑血管意外事件。长期应用还可引起骨质疏松、骨骺闭锁、骨膜增生、韧带肌腱钙化、骨生成迟缓等，影响儿童的生长和发育。故儿童和青少年长期应用需每6～12个月作腰部和长骨的X线检查。此外，本药有致畸和胚胎毒性，在终止治疗后需避孕2年以上，故育龄期妇女应在治疗前接受检查，以确定未孕。
环孢菌素A可引起剂量依赖性的肾功能受损和高血压，发生于平均用药1个月后，故应随访肾功能及血压，减少剂量或停药后均可恢复正常。
类固醇激素长期大剂量使用，可并发细菌、真菌或病毒等感染，产生消化性溃疡或出血、骨质疏松或骨折、血糖、血压异常、皮质功能抑制、肾上腺皮质功能亢进样外貌(满月脸、痤疮等)等副作用，因此，要监测血糖、血压、电解质、粪隐血等指标，必要时进行病原学检查，以防治继发感染。
此外，脓疱型牛皮癣本身可发生低蛋白血症、低钙血症、高脂血症、白细胞和中性粒细胞计数增高、血沉加快、肝酶升高等实验室检查异常，因此监测以上指标，既可以评估疾病的进展，亦可以及时防治药物的毒副作用，应定期随访。
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