强直性脊柱炎的病因和发病机制目前还不十分明确，研究已发现遗传和环境（细菌或微生物感染）是发病的重要因素，因此常常发现强直性脊柱炎患者的兄弟姐妹或其他亲属也患有相同疾病。
已证实强直性脊柱炎的发病和人类白细胞抗原（HLA-B27）密切相关，并有明显家族聚集倾向。
晨僵：晨僵是强直性脊柱炎常见的早期症状之一。患者早起觉腰部僵硬，活动后可以缓解。晨僵也是病情活动指标之一，病情严重者可持续全日。除活动外，热敷、热水浴也可使晨僵缓解。
腰痛：腰痛或不适是本病最常见症状，发生率90%左右。其发生隐匿，常为隐痛，难以定位。开始时患者常觉得疼痛或不适，部位在臀深部，疼痛严重者常位于骶髂关节，有时可放射至髂嵴或大腿后侧。疼痛可因咳嗽、喷嚏或其他牵扯腰背的动作而加重。
外周关节症状：半数以上病例病程中出现外周关节症状。外周关节受累为首发症状者，其中合并外周关节症状者50%左右，儿童强直性脊椎炎以外周关节炎为症状者更多见，儿童强直性脊椎炎病例中，75%的患者患有外周关节炎。
全身性疾病：强直性脊柱炎患者可侵犯眼睛、心脏、肺及肾脏等，侵犯眼睛可造成葡萄膜炎与虹膜炎，严重时可能失明。侵犯心脏多为无症状或轻微的主动脉瓣膜闭锁不全及传导阻滞，少数患者并发上肺部纤维化或肾功能异常。
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