高密度脂蛋白的主要功能是逆向运输胆固醇至肝脏代谢，具有抗动脉粥样硬化作用。其功能主要有清除外周组织多余胆固醇、抗氧化、抗炎、保护血管内皮、调节免疫功能等。
高密度脂蛋白可将血管壁及周围组织中沉积的胆固醇携带至肝脏，通过胆汁酸形式排出体外。这种逆向转运机制能减少胆固醇在动脉内膜的蓄积，降低泡沫细胞形成概率。载脂蛋白A-1是该过程的关键成分，能与细胞膜上的ATP结合盒转运体A1结合启动胆固醇外流。
高密度脂蛋白所含的paraoxonase-1等酶能降解氧化的低密度脂蛋白，防止氧化脂质损伤血管内皮细胞。其表面的磷脂和载脂蛋白可捕获自由基，抑制脂质过氧化链式反应，从而延缓动脉斑块的形成进程。
通过抑制血管细胞黏附分子-1的表达，高密度脂蛋白减少单核细胞向血管内皮的黏附。同时能中和内毒素，降低肿瘤坏死因子-α等炎症因子水平。这些特性有助于减轻血管壁炎症反应，改善内皮功能障碍。
高密度脂蛋白能促进一氧化氮合成酶活性，增加血管舒张因子一氧化氮的释放。还可刺激前列环素生成，抑制内皮素分泌，维持血管正常舒缩功能。对于糖尿病等代谢性疾病导致的内皮损伤具有修复作用。
高密度脂蛋白可与Toll样受体4结合阻断炎症信号通路，调节巨噬细胞极化方向。其携带的微小RNA能影响免疫细胞活性，在自身免疫性疾病和败血症过程中表现出双向免疫调控能力。
保持适度运动如快走、游泳等有氧锻炼有助于提升高密度脂蛋白水平，建议每周累计150分钟以上。饮食上可增加深海鱼类、坚果、橄榄油等不饱和脂肪酸摄入，限制反式脂肪酸及精制碳水化合物。吸烟会降低高密度脂蛋白功能，戒烟是改善脂质代谢的重要措施。对于存在脂代谢异常者，需定期检测血脂四项指标，必要时在医生指导下干预。
