牙根发黑可能由牙结石、龋齿、牙髓坏死、色素沉着或牙根外露等原因引起，可通过洗牙、补牙、根管治疗、牙周治疗等方式改善。
牙结石是沉积在牙齿表面的钙化菌斑和软垢，常呈黑色或褐色，尤其容易堆积在牙根和牙龈交界处。牙结石本身是细菌的温床，长期存在会刺激牙龈，导致牙龈红肿、出血，甚至引发牙周炎。伴随症状通常有刷牙出血、口腔异味。日常应注意正确刷牙并使用牙线，定期进行超声波洗牙，通常每半年到一年一次，可以有效清除牙结石。
牙根部位的龋齿称为根面龋，多见于中老年人或牙龈萎缩者。由于牙根表面没有坚硬的牙釉质保护，一旦清洁不到位，细菌容易侵入牙骨质和牙本质，形成黑色龋洞。根面龋早期可能没有明显感觉，随着发展会出现对冷热酸甜敏感，甚至疼痛。治疗上需要由医生去除腐坏组织后，使用玻璃离子或复合树脂等材料进行充填修复。
当牙齿因深度龋坏、外伤或长期磨损导致牙髓组织缺血坏死时，牙齿内部血管破裂，红细胞分解产物渗透到牙本质小管中，会使牙齿整体或局部呈现灰黑色，牙根区域尤为明显。这类牙齿通常没有疼痛感，但会变得脆弱，容易劈裂。确诊后需要进行根管治疗，清除坏死的牙髓组织，再完成牙冠修复以保护剩余牙体。
长期饮用浓茶、咖啡、红酒或吸烟，烟草中的焦油和茶渍中的色素会附着在牙根表面，形成难以刷掉的黑色或褐色斑块。这种外源性色素沉着通常不伴有疼痛或牙齿缺损，但影响美观。日常减少色素性饮食摄入，使用含焦磷酸盐或碳酸氢钠的牙膏有助于减缓色素沉积，严重时可到口腔科进行喷砂洁治来去除。
牙根外露常由牙周病或刷牙方式不当导致牙龈萎缩引起。暴露的牙根表面容易吸附食物残渣和色素，同时牙根颜色本身比牙冠偏黄，在口腔环境中会显得发黑。伴随症状包括牙齿遇冷热敏感、牙缝变大、牙齿松动。治疗上需要先控制牙周炎症，通过牙周基础治疗如龈下刮治和根面平整，配合使用抗敏感牙膏，必要时进行牙龈移植手术覆盖暴露的牙根。
日常护理中建议使用软毛牙刷配合巴氏刷牙法，每天刷牙两次，每次不少于两分钟，饭后用牙线或冲牙器清洁牙缝。减少含糖食物和深色饮料的摄入，戒烟限酒。每半年到一年进行一次口腔检查和洁牙，发现牙根发黑及时就医，由医生明确原因后采取针对性处理，避免自行用尖锐工具刮除或使用不明成分的漂白产品，以免损伤牙根和牙龈。
