乙肝表面抗原是乙肝病毒的外壳，对乙肝病毒DNA起到保护作用，是体内存在乙肝病毒感染的标志之一。乙型肝炎的特点是病程长，容易迁延。乙肝表面抗原阳性者急性发病后进入慢性期的则更是多见。
发生重症肝炎的病例极少，不超过0.3%。
自然转阴
随着时间推移，机体免疫状态改善，部分乙肝表面抗原阳性者的乙肝表面抗原可自行转阴。国内报道，凡是母婴垂直传播的携带者，乙肝表面抗原的自然阴转率很低，一般低于2%，18岁以后的青壮年的自然阴转率在1.25%～3.4%，同时有e抗原阳性者更难转阴。
稳定的携带状态
有不少患者终身携带乙肝表面抗原，发现乙肝表面抗原数十年阳性，但最终死于非肝性疾病。在曾经报道218例无症状乙肝表面抗原阳性者中，有48.2%的肝脏有轻微病理变化，可能这种变化就是相对稳定的一种乙肝病毒持续感染的低反应状态。在我国这种情况十分普遍。
发生临床显性肝炎
部分乙肝表面抗原阳性者在携带过程中出现肝功异常，其中乙肝表面抗原与e抗原持续阳性者易发展成慢性肝炎，还有少数是与丁型肝炎重叠感染，个别还不能排除其它病毒引起的肝损害。
发生慢性活动性肝炎、肝硬化甚至肝癌
乙肝表面抗原阳性者发生慢性活动性肝炎者可达1%～3%，少数人可发展为非活动性肝硬化，已发生肝硬化的患者中9.9%～16.6%有发生肝癌的机会，个别报告已发生肝硬化的患者中有42.1%可伴发肝细胞癌。
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