乙肝患者治疗不及时或治疗不当会发生肝硬化，肝硬化患者最迫切的任务就是要抗病毒，乙肝发生肝硬化患者的抗病毒治疗与常规患者的抗病毒治疗有很大的区别。
肝硬化一般分为代偿期和不代偿期，患者所处的阶段不同，抗病毒治疗原则也不同。
代偿期
代偿期的乙肝合并肝硬化患者，抗病毒治疗过程中，首要关注的是安全性，抗病毒的药物主要选择核苷酸类药物。一般首选拉米夫定。因其有10年的上市经验，被医生公认为所有抗病毒药物中安全性最好的药物，同时研究显示，在肝硬化患者拉米夫定3年持续治疗期间，减少了50%肝癌、肝硬化的发生。由于干扰素有可能导致肝功能失代偿等并发症，应该十分慎用。如非用不可，则需密切监测，一旦肝功能出现波动，就要考虑停药。
失代偿期
失代偿期乙肝合并肝硬化的患者，会出现腹水、黄疸等情况，通过抗病毒治疗，可以保护好残余的肝细胞，为患者下一步的治疗做好准备。
失代偿期乙肝合并肝硬化的患者存在着肝脏功能衰竭的风险，所以禁止使用干扰素，只能选用核苷类似物。鉴于这部分患者可能需要终身治疗，选药时还需考虑安全性、疗效和费用等情况。
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