强直性脊柱炎的具体病因尚不清楚。大多认为与遗传、感染、免疫、内分泌失调及其他环境因素有关。
1、遗传因素流行病学调查显示遗传因素在强直性脊柱炎的发病中起重要作用。
2、感染因素近几年来研究提示，强直性脊柱炎发病可能与感染有关。
3、免疫异常强直性脊柱炎患者的白细胞趋化性增高，吞噬能力增强。
淋巴细胞增生，
活性增加。细胞毒T细胞活件增强，参与组织的损伤。这些提示细胞免疫异常在强直性脊柱炎的发病中起一定作用。
在体液免疫方面，大多数强直性脊柱炎患者的免疫球蛋白IgG升高，在强直性脊柱炎患者血清中存在多种自身抗体，如抗果蝇染色体93D位点抗体、抗组蛋白抗体、抗HLA-B27多肽抗体等，这些抗体能诱发免疫反应，从而出现多关节炎，导致脊柱的僵硬和破坏。
此外，大部分强直性脊柱炎患者有IGA类风湿因子，血清中有循环免疫复合物(CIC)。
以上这些现象提示免疫异常是本病的一个重要因素。
4、其他因素AS多发生于青壮年男性，明显的性别差异，可能与内分泌有关。代谢障碍、外伤、变态反应、神经营养障碍也认为可能与本病发生有一定关系。
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