原发性生殖器疱疹是指患者生殖器初次感染HSV，血中无抗体。其临床症状如下：
1.全身症状
大多数患者无症状，有症状者在病程早期即出现全身症状。在病损发生后3-4天内达高潮。有发热(有时达39℃以上)、头痛、不适及肌痛，见于70%女患者及40%的男患者中。国内该病的全身症状少见。
2.局部症状
(1)男性：发病后的6～7天，局部症状逐渐加重，到7-11天时达最严重，2周后逐渐消退。皮损主要发生在外生殖器部位，如阴茎头冠状沟、尿道口、尿道内、阴茎体及阴囊等部位。原发性损害是少数或多数小红丘疹，有痒感，迅速变成小水疱。水疱一般簇集，但也有散在者，一般边缘有红晕，有的只有基底浅红，甚至只有红斑而无水疱。3-5天后水疱发生糜烂或溃疡，并有剧烈的疼痛，溃疡的大小及形状有很大差异。溃疡可持续4-15天，直至结痂，出现上皮重新形成，黏膜损害不结痂。病损愈合后不留瘢痕者不常见。75%患者在病程中可发生新损害，新损害发生于病程的7-10天之间。从发生水疱到结痂平均10.5天，从发生损害到所有损害上皮重新形成平均16.5天。
1/3患者有尿道分泌物及排尿困难，尿道分泌物清，呈黏液状。排尿困难的严重程度与尿道分泌物的量不成比例。尿道拭子或清晨首次排空的尿液可分离到HSV。同性恋者可出现肛门直肠生殖器疱疹。
(2)女性：一般表现为外阴阴道炎，大部分患者发生宫颈炎。常见的临床症状有阴道分泌物增多，还有排尿困难及尿潴留。病损可波及肛门及腹部皮肤，局部淋巴结肿大及触痛。损害于1～2周内愈合，但有时发生新损害，持续时间有时可达6周。有口交者可发生咽部感染，肛交者出现肛门感染。
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