原发感染多为隐性，大多无临床症状或呈亚临床表现，仅有少数（1％～10％）可以出现临床症状。原发感染消退后，病毒潜伏于神经节内。正常人中约有半数以上为本病毒的携带者，可通过口、鼻分泌物而成为传染源，由于HSV在人体中不产生永久免疫力，当机体免疫功能低下时，如患某种发热性传染病、胃肠功能紊乱、月经、妊娠、病灶感染、过度疲劳、情绪波动、环境改变时，体内潜伏的HSV即被激发而发病，出现一系列临床症状。
HSV感染的潜伏期为2～3天。HSV一2感染主要发生于生殖器部位，患部先有烧灼感或轻微感觉异常，很快在红斑的基础上发生成群的小水疱，男性多见于包皮、龟头、冠状沟阴囊、尿道口、阴茎等处：女性常见于大小阴唇、阴蒂，约80%患者同时侵犯宫颈，表现为宫颈红肿、溃疡、阴道分泌物多。水疱可逐渐变成脓疱，进而形成糜烂或浅的溃疡，自觉疼痛。患者可发生尿道炎，出现排尿困难。绝大部分患者有腹股沟淋巴结肿大和疼痛，70%以上的患者可出现发热、头痛、肌痛及全身不适症状。部分患者因局部病变蔓延，约30%的女性和15%的男性可出现无菌性脑膜炎，表现为头痛，颈项强直等，脑膜炎可有短期后遗症，一般3～6个月才能消除。10%～20%的患者伴有生殖器以外部位的感染，可累及口唇、大腿、臀部、手指、乳房及中枢神经系统等。孕期患生殖器疱疹时易致流产、早产或死胎，并易使新生儿感染，发生新生儿单纯疱疹。本病一般经过3周左右可以痊愈，但常会反复发作。
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