牙菌斑主要通过机械性物理清除方法去除，包括日常正确刷牙、使用牙线、定期洗牙以及遵医嘱使用特定漱口水等方式。牙菌斑是口腔内细菌在牙齿表面形成的黏性薄膜，若不及时清除，会矿化形成牙结石，并可能引发龋病和牙周疾病。
每天至少早晚两次使用含氟牙膏进行有效刷牙是去除牙菌斑的基础方法。建议采用巴氏刷牙法，将刷毛与牙面呈45度角，对准牙齿与牙龈交界处，进行小范围水平颤动，每次刷牙时间不少于2分钟。这种方法能有效清除牙龈沟内和牙面上的菌斑。需要注意的是，刷牙无法彻底清洁牙齿邻面，因此需要配合其他工具。
牙线是清除牙齿邻面牙菌斑最有效的工具。牙刷刷毛无法进入牙缝，而牙菌斑极易在相邻牙齿的接触面堆积。建议每天至少使用一次牙线，将牙线轻柔地滑入牙缝，紧贴一侧牙面呈C形包绕，上下刮擦。对于牙缝较大的人群，也可以使用牙缝刷，其清除效果优于普通牙线。
即使日常清洁到位，仍会有少量牙菌斑矿化形成牙结石，此时无法通过刷牙去除。建议每半年到一年进行一次超声波洁治，即专业洗牙。超声波器械通过高频振动震碎并清除牙结石和附着其上的菌斑。洗牙后牙齿表面可能变得粗糙，医生通常会进行抛光处理，减缓菌斑再次附着。
冲牙器通过高压脉冲水流冲洗牙缝和牙龈沟，能辅助清除部分松散的牙菌斑和食物残渣。对于佩戴正畸矫治器、固定桥或种植牙的人群，冲牙器能有效清洁死角。但冲牙器不能替代牙线或刷牙，因为水流对牢固附着在牙面的菌斑清除能力有限，需作为辅助工具使用。
部分含有氯己定、精油或氟化亚锡等成分的漱口水，在特定情况下可辅助抑制牙菌斑。例如，氯己定漱口水能有效减少口腔内细菌数量，但长期使用可能导致牙齿染色或味觉改变，因此需在医生指导下短期使用。日常保健可选择含精油或氟化物的漱口水，但漱口水无法替代物理清洁，仅作为补充手段。
去除牙菌斑的核心在于持续且有效的日常清洁，建议养成早晚刷牙、饭后漱口、每天使用牙线的习惯。饮食上应减少摄入黏性甜食，如糖果、饼干等，这类食物易附着在牙面促进菌斑形成。定期进行口腔检查，若发现刷牙时牙龈出血、牙齿表面有粗糙感或口腔异味，应及时就医评估是否存在牙结石或牙周问题。保持良好的口腔卫生习惯，能有效预防龋齿和牙周疾病的发生。
