在临床诊断上，根据皮损发生于外生殖器部位，呈多形性皮疹，有瘙痒，易渗出，慢性过程，常反复加重等，很容易诊断出外生殖器部位湿疹
但由于症状的相似，外生殖器湿疹还是需要与以下的疾病加以区分：
(1)外生殖器部位的瘙痒症
晚期阴囊或女阴搔痒症可有皮肤增厚、浸润、渗出等，与外生殖器的湿疹颇难鉴别。鉴别在于病中询问，外生殖器瘙痒症初期仅有瘙痒而无原发性皮损。
（2)外生殖器部位的神经性皮炎
阴囊和大阴唇为神经性皮炎多发部位，损害为苔藓样变，边缘部分常有扁平的苔藓化丘疹。与湿疹不同点是，病程中时轻时重和浆液性渗出倾向均不明显。
为浅部真菌感染，损害为针头大小丘疹，排列成环状，常有清楚的边缘，伴糠状脱屑。取鳞屑作真菌检查可查见菌丝和孢子。
(4)女阴黏膜白斑
多见于40岁以上女性。
损害主要累及阴蒂、小阴唇及大阴唇内侧黏膜部分，为灰白色斑伴角化过度，剧痒
(5)外生殖器部位的接触性皮炎
此部位的接触性皮炎常因为穿带颜色的内裤而导致染料过敏，或者因手接触了生漆等致敏物质后，又触摸生殖器而引起的过敏。除外生殖器出现红斑、肿胀、丘疹、水疱外，臀部、大腿内侧及面部常有类似损害。病程较短，除去病因后一般1~2周痊愈。
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