在强直性脊柱炎早期，单纯以外周关节炎表现为主时特别需要与类风湿关节炎进行鉴别，两者可通过发病人群不同、关节症状不同、有无类风湿、受累范围不同、相关抗原不同等几大方面进行鉴别。
1、发病人群不同：强直性脊柱炎和类风湿关节炎发病人群不同，强直性脊柱炎在男性多发，类风湿关节炎则好发于女性。
2、关节症状不同：外周关节炎在强直性脊柱炎为少数关节、非对称性，且以下肢关节为主，并常伴有肌腱端炎；在类风湿关节炎则为多关节、对称性和四肢大小关节均可发病。
3、有无类风湿：强直性脊柱炎的类风湿因子阴性，无类风湿关节炎可见的类风湿结节，而类风湿关节炎的阳性率占60%~95%。
4、受累范围不同：强直性脊柱炎主要侵犯骶髂关节、脊柱骨突、脊柱旁软组织及外周关节，无一例外有骶髂关节受累，并可伴发关节外表现。
类风湿关节炎则好发于手、腕、足等小关节，很少有骶髂关节病变。
5、相关抗原不同：强直性脊柱炎与HLA-B27相关，大多数患者表现为HLA-B27阳性，而类风湿关节炎则与HLA-DR4相关。
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