感染衣原体可能引起尿道炎、宫颈炎、盆腔炎、附睾炎、反应性关节炎等症状，早期表现为分泌物异常，进展期出现疼痛，终末期可能导致不孕或慢性疼痛。
衣原体感染泌尿系统时，患者早期常感到尿道口有轻微灼热感或刺痛感，排尿时症状加剧。男性可见尿道口流出稀薄黏液，女性则伴有尿频、尿急现象。这通常由病原体侵袭尿道黏膜导致炎症反应引起。针对此类情况，可遵医嘱使用阿奇霉素片、多西环素胶囊或左氧氟沙星片进行抗感染治疗，同时增加饮水量以冲刷尿道，减少病原体滞留。
随着病情发展，生殖道分泌物会发生明显改变。男性患者晨起时发现尿道口有脓性或黏液性分泌物封堵，女性患者白带增多且呈脓性，有时伴有异味。这是由于衣原体在宫颈或尿道内大量繁殖，诱发局部化脓性炎症所致。治疗上需及时就医，医生可能会开具盐酸米诺环素胶囊、罗红霉素分散片或克拉霉素片等药物，以抑制细菌蛋白合成，消除感染源。
若感染上行蔓延至女性上生殖道，可引发盆腔炎，表现为下腹部持续性隐痛或坠胀痛，劳累或性交后加重。男性若波及附睾，则出现阴囊肿胀和触痛。此阶段病理损害已涉及深层组织，可能形成粘连或瘢痕。临床常联合使用头孢克肟分散片、甲硝唑片配合前述大环内酯类药物治疗，必要时需卧床休息，避免剧烈运动以防炎症扩散。
部分重症患者或免疫力低下者，可能出现发热、乏力、肌肉酸痛等全身中毒症状，甚至伴有腹股沟淋巴结肿大。这表明感染已引起机体强烈的免疫应答反应。此时单纯口服药可能不足，需医生评估后调整方案，如使用注射用头孢曲松钠联合口服多西环素胶囊，并密切监测体温变化，保证充足睡眠以辅助身体恢复。
未经治疗的长期感染可导致严重后果，如女性输卵管堵塞致不孕、异位妊娠，男性输精管阻塞致不育，或引发反应性关节炎、结膜炎等肠外表现。这是病原体持续破坏组织结构的终末期损害。治疗难度加大，除强化抗生素疗程外，可能需物理治疗或手术干预疏通管道，务必严格遵循医嘱完成全程治疗，防止不可逆损伤发生。
日常生活中应保持良好的个人卫生习惯，勤换内衣裤，避免不洁性行为，使用安全套可有效降低感染风险。若出现上述任何症状，切勿自行购药服用，应立即前往正规医院皮肤性病科或泌尿外科就诊，接受专业检查与规范治疗，同时通知性伴侣共同检查治疗，以免交叉感染或病情反复，确保生殖健康与生活质量。
