重度肺动脉高压需通过靶向药物联合氧疗、抗凝治疗、利尿剂及手术干预综合控制。治疗方法主要有马西替坦、利奥西呱等靶向药物，抗凝治疗，利尿消肿，房间隔造口术和肺移植。
内皮素受体拮抗剂如马西替坦可改善血管收缩，5型磷酸二酯酶抑制剂如他达拉非能降低肺血管阻力，前列环素类似物如伊洛前列素通过雾化吸入直接扩张肺动脉。这三类药物需根据WHO功能分级联合使用，定期监测肝功能及血压。
华法林等抗凝剂用于预防原位血栓形成，维持INR值在2-3之间。合并右心衰竭时需评估出血风险，避免与NSAIDs类药物联用。抗凝期间需监测牙龈出血、皮下瘀斑等不良反应。
呋塞米联合螺内酯可缓解右心衰竭导致的下肢水肿和腹水，使用时需监测电解质平衡。每日体重变化超过2公斤需调整剂量，严重水肿者可短期静脉用药。
对靶向药物治疗无效的WHO功能IV级患者，通过心导管在房间隔制造分流孔减轻右心负荷。术后可能出现低氧血症，需持续氧疗维持血氧饱和度>90%。
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