新生儿肺动脉高压多数情况下可以治愈，治疗效果与病因、病情严重程度及干预时机密切相关。主要治疗方式包括氧疗支持、药物治疗、机械通气、体外膜肺氧合ECMO以及原发病治疗。
轻中度患儿通过高浓度氧疗可改善低氧血症，降低肺动脉压力。常采用头罩或鼻导管吸氧，目标维持血氧饱和度在90%-95%。氧疗需持续监测以避免氧中毒，同时需纠正酸中毒等诱发因素。
一线药物包括西地那非扩张肺血管、米力农增强心肌收缩、前列环素抑制血小板聚集。严重病例可能联合使用一氧化氮吸入治疗，需严格监测血压及循环状态，避免体循环低血压。
合并呼吸衰竭时需采用常频或高频振荡通气，参数设置以维持适度过度通气PaCO230-35mmHg为目标。通气策略需平衡氧合与气压伤风险，尤其注意早产儿肺发育特点。
对药物难治性病例，静脉-动脉ECMO可提供心肺功能替代。适用于胎龄≥34周、体重≥2kg且无严重颅内出血的患儿，平均支持时间5-7天，需团队评估撤机时机。
继发于败血症者需敏感抗生素，先天性膈疝需手术修复，持续肺动脉高压新生儿PPHN可能需肺表面活性物质替代。病因解除后肺动脉压力多可逐步回落。
母乳喂养可提供免疫保护，哺乳期母亲需避免服用影响凝血功能的药物。恢复期定期随访心脏超声，监测肺动脉压力及右心功能。避免寒冷刺激与剧烈哭闹，居家护理注意观察喂养耐受性及皮肤颜色变化。建议接种肺炎球菌疫苗等常规免疫，预防呼吸道感染诱发病情反复。
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