纤维支气管镜检查有助于了解哮喘病人气道炎症状况。哮喘病人即使在缓解期仍可见其黏膜有炎性发硬；发作期则见黏膜明显水肿，分泌液粘稠，附着管壁，不易去除。伴有感染时，则呈脓液状，呼气时气管及支气管壁呈塌陷现象。通过纤支镜作为支气管壁的活组织检查是研究哮喘发作患者的一种方法。
纤支镜活检出硬质支气管基底膜增厚和嗜酸粒细胞的浸润，可做出哮喘的诊断。若活检标本中包括黏膜下层的腺体组织，则可测出腺泡的直径，即小管的横切面。腺泡的直径增大，提示支气管黏液腺肥大，并有慢性支气管炎的表现。同时，通过支气管肺泡灌洗或活检，可进一步明确气道壁炎症的程度和治疗的效果。
其次，纤维支气管镜对于鉴别诊断也很重要。某些气道疾病，如肿瘤、支气管内膜结核可表现为胸闷、呼吸困难，医生听诊可闻及哮鸣音，易误诊为哮喘。
纤支镜检查除了帮助鉴别诊断，亦可用于哮喘的治疗。例如严重支气管哮喘由于粘稠痰液或黏液栓阻塞而引起者，往往可借纤支镜吸出阻塞物而得缓解。
在某些情况下，如出现肺不张时，纤支镜的吸引常可作为唯一的治疗措施。近年来，对急性严重哮喘发作患者试用支气管冲洗，以排除支气管腔内填塞的黏液栓。最简单的方法是通过纤支镜向支气管腔内注入少量液体，然后间隔一段时间后，吸出液体，反复进行，直至黏液栓排出为止。
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