面肌痉挛的原因主要是面神经出桥脑根处被走行的小动脉压迫，这些血管有曲张的粗大静脉，也有小脑前下和后下动脉等。具体面肌痉挛的原因，经过长期的临床观察分析，作出了以下结论。
根据产生面肌痉挛的原因可将此病分为特发与继发两种。继发性者亦称症状性面肌痉挛，凡在大脑皮层到面神经偶分支末梢的整个通道中，任何压迫刺激性病变均可诱发此病。临床常见的如中耳乳突炎症和肿瘤，桥小脑角的占位性病变(胆脂瘤和听神经瘤)及脑炎，蛛网膜炎，多发性硬化，Paget病和颅凹陷症等。凡查不出诱因者，统称为特发性痉挛，约占发病总数的2/3。
人到中年以后，这些正常和神经交叉压迫的血管开始硬化，血压升高，长期压迫神经可引起脱髓鞘变性，使神经轴索间发生串电现象，兴奋由传出而变成传入，可有大量异常电位蓄积和发放，可成为引发面肌痉挛的原因。
此论点还可用以解释三叉神经痛和舌咽神经痛的病因。
面肌痉挛的原因还可能是面瘫等神经性疾病的后遗症，这也是常见的面肌痉挛的原因。现代很多污染物也可能诱发面肌痉挛，一些化工类职业者多患面肌痉挛的原因就是这个，也要特别注意。
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