对于临床怀疑而普通X线检查不能确诊的强直性脊柱炎患者，可以行CT检查。CT能清晰显示骶髂关节间隙，便于测定关节间隙有无增宽、狭窄、强直或部分强直。
美国科学家研究了36例患者，24例为炎性下背痛，12例为机械压力所致下背痛的患者，通过标准的X线检查骶髂关节正常。但应用MRI检查发现54%的炎性下背痛和17%的机械原因性下背痛的患者有骶髂关节炎。
用单光子发射计算机断层扫描（SPECT)检查发现38％的炎性下背痛存在骶髂关节炎，而机械原因组无此发现。MRI和SPECT同时检查阳性发现率明显升高，炎性下背痛者58%和机械性下背痛者1796的患者存在骶髂关节炎。因此，研究者认为MRI和SPECT闪烁造影骶髂关节拍片非常有助于强直性脊柱炎的早期诊断和治疗，从这个角度讲明显优于普通X线检查，但费用昂贵，不提倡作为常规检查。
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